学校支援本部は、事務局長をトップとする本部を置きます（以後本部とはこの限られた範囲を指します）。事務局長は学校側との調整を図り、学校支援本部全体の事業を監督します。本部には、事務局長を補佐する会計、庶務、広報、安全管理などの担当が置かれます。本部の下に、各事業が配置されます。事業は、年間を通して運営する事業（和田中学校では読書振興事業、学力振興事業、緑化振興事業など）と、不定期で行われる事業や、イベント的な事業などがあります。


　

原則として、教員が学校支援本部の事業に参加する必要はありません。逆に先生の授業を手伝う場合は、通常の授業時間帯に学校支援本部のメンバーが参加することがあります。また、夏休みの特別プログラムなどで、先生と学校支援本部が協力して行う事業もあります。このように、先生と学校支援本部は足並みを揃えて表裏一体で行動しますので、相互のコミュニケーションが非常に重要になってきます。学校全体の動きや、生徒一人ひとりの様子をできる限り連絡しあうことによって、生徒へのきめの細かい配慮ができるようになります。

現PTAのメンバーが学校支援本部のメンバーになることはありません。また、PTAの活動は、先生と保護者との連携が主な目的なので、PTAの活動と学校支援本部の活動が競合することはありません。